受控文库,也称为定点不饱和文库或Trimer文库,是与简并文库类似的一类文库,不同的是受控文库的氨基酸突变点被其他20种氨基酸中的某几种替代,而不是所有的20种。并且替代的几种氨基酸的占比可以是平均的,也可以是人为控制按照特定比例的。受控文库的主要目的是为了减少理论库容数,去掉一些大概率的无义突变,从而减少后期的筛选工作量,将研究的重点放在其中的最可能得到符合条件的突变体的序列上,从而为深入的研究少数氨基酸突变带来方便。例如深入研究酶催化位点周围的少数氨基酸对酶催化特性的影响。
受控文库往往是通过Trimer引物来实现的。不同于普通引物合成时的单核苷酸是一个一个的合成上去的,Trimer引物是三个单核苷酸预先联结成核苷酸三联体(即Trimer),在合成引物的时候,希望该位置出现什么氨基酸,把相应的Trimer联结上去即可。希望该位置出现几种氨基酸,就把这几种氨基酸的Trimer混合后联结上去即可。通过控制各个Trimer的比例控制成品文库中该位置各个氨基酸的占比。